自然人股权转让的应纳税额=（股权转让收入-股权原值-合理费用）*20%，之前的文章中对“股权转让收入”进行了详细的分析，详见“自然人股权转让个人所得税之“股权转让收入”分析，本文就“股权转让原值”的相关问题进行分析。

　　一、股权转让原值确认的基本方法

　　（一）以现金出资方式取得的股权，按照实际支付的价款与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值；（二）以非货币性资产出资方式取得的股权，按照税务机关认可或核定的投资入股时非货币性资产价格与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值；（三）通过无偿让渡方式取得股权，具备本办法第十三条第二项所列情形的，按取得股权发生的合理税费与原持有人的股权原值之和确认股权原值；（四）被投资企业以资本公积、盈余公积、未分配利润转增股本，个人股东已依法缴纳个人所得税的，以转增额和相关税费之和确认其新转增股本的股权原值。（五）除上述情形外，由主管税务机关按照避免重复征收个人所得税的原则合理确认股权原值。

　　实务举例：王某持有A公司20%的股权，初始投资成本为400万，2017年年底A公司净资产2000万，王某2018年1月将自己的股权以1元的价格转让给自己儿子小王，小王取得A公司20%的股权后，2018年10月，王某以2200万的价格将股权转让给张某。

　　本例中，虽然王某以1元的价格将其持有的A公司20%的股权转让给小王，但因小王是王某的儿子，税务机关不必核定股权转让收入征收个人所得税。

　　《股权转让所得个人所得税管理办法》第十三条符合下列条件之一的股权转让收入明显偏低，视为有正当理由：（二）继承或将股权转让给其能提供具有法律效力身份关系证明的配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人。

　　本着不重复征税的原则，股权原值应为王某投资成本400万元，因此，小王在本次股权转让中应当缴纳的个人所得税=（2200-400）*20%=360万元。

　　二、再次转让股权原值的确定

　　（一）受让人再次转让股权原值的确定

　　《股权转让所得个人所得税管理办法》第十六条规定自2015年1月1日起股权转让人已被主管税务机关核定股权转让收入并依法征收个人所得税的，该股权受让人的股权原值以取得股权时发生的合理税费与股权转让人被主管税务机关核定的股权转让收入之和确认。

　　实务举例：李某持有甲公司50%的股权，投资成本为500万，2018年5月，李某将其持有的股权转让给张某，税务机关按照净资产和定法，核定股权转让收入为1500万，张某按照税务机关的核定代扣代缴了个人所得税200万元。2018年10月，张某再次转让给股权，转让价格为1600万。

　　本例中，张某应当缴纳的个人所得税为（1600-1500）*20%=20万元。

　　案例延伸：若上述交易发生在2014年，按照国家税务总局2010年27号公告第四条的规定（纳税人再次转让所受让的股权的，股权转让的成本为前次转让的交易价格及买方负担的相关税费），张某应缴纳的个人所得税为（1600-500）*20%=220万元。此时，1000万元的增值所得被征收了两次个人所得税，造成了重复纳税。

　　（二）盈余公积转增股本后转让股权原值的确定

　　国家税务总局2013年第23号公告对于盈余累计向个人投资者转增股本个人所得税的问题进行了区分处理，本文就两种情形中的其中一种情形举例说明：

　　新股东以不低于净资产价格收购股权的，企业原盈余积累已全部计入股权交易价格，新股东取得盈余积累转增股本的部分，不征收个人所得税。

　　赵某持有甲公司100%股权，2017年3月，赵某将其持有的家公司100%的股权以2250万元的价格转让给孙某，转让时家公司净资产为2000万元（股本500万元，未分配利润1000万元，盈余公积250万元，资本公积-其他资本公积250万元），2017年9月，孙某将1375（未分配利润1000万元，盈余公积125万元，资本公积-其他资本公积250万元）转增股本，转增股本后，甲公司股本为1875万元。2018年5月，孙某将甲公司100%股权转让给钱某，转让价格为2400万。

　　赵某应缴纳的个人所得税=（2750-1000）*20%=350万元。

　　孙某应缴纳的个人所得税=（2400-2250）*20%=30万元。

　　三、加权平均法确定股权原值

　　《股权转让所得个人所得税管理办法》第十八条规定对个人多次取得同一被投资企业股权的，转让部分股权时，采用“加权平均法”确定其股权原值。

　　陈某2016年以200万元价格投资B公司，持有B公司10%的股权，2017年又投资300万取得B公司10%的股权，2018年又投资400万元取得B公司30%的股权。2019年陈某将其持有的10%的股权转让给李某，转让价格为600万元。根据加权平均法，股权原值为（200+300+400）/0.3*0.1=300万元。

　　陈某应缴纳个人所得税=（600-300）*20%=60万。